Perl模块安装 发表于 2018-05-15 | 分类于 Perl | 阅读次数 | 字数统计 168 | 阅读时长 1查看已安装模块perllocal 可以列出每个安装的模块的信息,如安装的时间、安装的位置、版本信息等1perldoc perllocal或者1perldoc 模块名如果已经安装该模块,上述命令会弹出该模块的帮助文档Perl模块安装手动安装去CPAN搜索下载需要的模块,参考README,运行如下命令: ...阅读全文 »
汉字编码:GB2312, Big5, GBK, GB18030 发表于 2018-05-15 | 分类于 Linux | 阅读次数 | 字数统计 1,218 | 阅读时长 4话说计算机是由美国佬搞出来的嘛,他们觉得一个字节(可以表示256个编码)表示英语世界里所有的字母、数字和常用特殊符号已经绰绰有余了(其实ASCII只用了前127个编码)。后来欧洲人不干了,法国人说:我需要在小写字母加上变音符号(如:é),德国人说:我也要加几个字母(Ä ä、Ö ö、Ü ü、ß)。于是 ...阅读全文 »
refGene文件解析 发表于 2018-05-15 | 分类于 BI | 阅读次数 | 字数统计 378 | 阅读时长 2简介RefGene数据库是从UCSC数据库创建而来。RefGene指定了取自NCBI RNA参考序列集合(RefSeq)的已知人类蛋白质编码和非蛋白质编码的基因,用于注释变异基因。hg19 RefGene 下载方式:1wget http://hgdownload.cse.ucsc.edu/golde ...阅读全文 »
Linux下scp命令 发表于 2018-05-10 | 分类于 Linux | 阅读次数 | 字数统计 858 | 阅读时长 3scp是secure copy的简写,用于在Linux下进行远程拷贝文件的命令,和它类似的命令有cp,不过cp只是在本机进行拷贝不能跨服务器,而且scp传输是加密的。可能会稍微影响一下速度。当你服务器硬盘变为只读 read only system时,用scp可以帮你把文件移出来。另外,scp还非常不 ...阅读全文 »
Linux修改主机名 发表于 2018-05-10 | 分类于 Linux | 阅读次数 | 字数统计 234 | 阅读时长 1Linux系统安装好后,都会有默认的主机名,这里以CentOS系统为例,默认的主机名为localhost.localdomain,为了便于使用,我们常常需要修改主机名,下面演示的是永久更改主机名的方法。登录以根用户登录,或者登录后切换到根用户,然后在提示符下输入hostname命令,可以看出当前系统 ...阅读全文 »
Linux下/etc/fstab文件详解 发表于 2018-05-10 | 分类于 Linux | 阅读次数 | 字数统计 965 | 阅读时长 4/etc/fstab是用来存放文件系统的静态信息的文件。位于/etc/目录下,可以用命令less /etc/fstab 来查看,如果要修改的话,则用命令 vi /etc/fstab 来修改。当系统启动的时候,系统会自动地从这个文件读取信息,并且会自动将此文件中指定的文件系统挂载到指定的目录。在这个文 ...阅读全文 »
Linux swap分区配置 发表于 2018-05-09 | 分类于 Linux | 阅读次数 | 字数统计 337 | 阅读时长 1我们一般所说的swap,指的是一个交换分区或文件。从功能上讲,交换分区主要是在内存不够用的时候,将部分内存上的数据交换到swap空间上,以便让系统不会因内存不够用而导致oom或者更致命的情况出现。所以,当内存使用存在压力,开始触发内存回收的行为时,就可能会使用swap空间。生成swap文件先填充一个 ...阅读全文 »
疾病风险评估流程 发表于 2018-04-27 | 分类于 BI | 阅读次数 | 字数统计 2,124 | 阅读时长 7在评估每种疾病的患病风险时,首先查找国际上对该疾病的研究人群以及样品数量并进行筛选与评估。对于GWAS研究,根据P值、OR值、连锁不平衡系数D’等参数对突变位点进行评估;NGS相关的研究,需要对突变进行基因组注释,筛选有意义的突变,根据疾病数据库和ACMG标准和指南对突变进行分类以及致病风险评估。最 ...阅读全文 »
VirtualBox CentOS安装增强功能与设置共享文件夹 发表于 2018-04-27 | 分类于 Linux | 阅读次数 | 字数统计 293 | 阅读时长 1设置CentOS 6.x 网络默认情况下载的centos 6.x minimal是不开启网卡功能的,按照下面的步骤开启网卡。123456789 vi /etc/sysconfig/network-script/ifcfg-eth0 # 将其中的ONBOOT=no修改为ONBOOT=yes#然后重新启 ...阅读全文 »
淘宝npm镜像使用方法 发表于 2018-04-26 | 分类于 Web , Hexo | 阅读次数 | 字数统计 83 | 阅读时长 1淘宝 npm 地址: http://npm.taobao.org/临时使用1npm --registry https://registry.npm.taobao.org install express持久使用12345npm config set registry https://registry. ...阅读全文 »